MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL2

Total Repeats: 2103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011996	GAA	2	6	5	10	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011996	AGG	2	6	35	40	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011996	TAA	2	6	155	160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011996	ATTTG	2	10	176	185	20 %	60 %	20 %	0 %	222142577
5	NC_011996	AT	3	6	272	277	50 %	50 %	0 %	0 %	222142577
6	NC_011996	TAGAA	2	10	320	329	60 %	20 %	20 %	0 %	222142577
7	NC_011996	AT	3	6	350	355	50 %	50 %	0 %	0 %	222142577
8	NC_011996	TGA	2	6	395	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142577
9	NC_011996	ATA	2	6	454	459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142577
10	NC_011996	TGT	2	6	545	550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142577
11	NC_011996	GTG	2	6	607	612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222142577
12	NC_011996	TCA	2	6	620	625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142577
13	NC_011996	CCA	2	6	663	668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222142577
14	NC_011996	GTTT	2	8	696	703	0 %	75 %	25 %	0 %	222142577
15	NC_011996	CAA	2	6	823	828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142577
16	NC_011996	ACGA	2	8	837	844	50 %	0 %	25 %	25 %	222142577
17	NC_011996	GCT	2	6	852	857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222142577
18	NC_011996	TAGAAA	2	12	890	901	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222142577
19	NC_011996	ATT	2	6	957	962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142577
20	NC_011996	TAC	2	6	973	978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142577
21	NC_011996	ATA	2	6	1030	1035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142577
22	NC_011996	AGA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142577
23	NC_011996	GGAA	2	8	1201	1208	50 %	0 %	50 %	0 %	222142577
24	NC_011996	AT	3	6	1241	1246	50 %	50 %	0 %	0 %	222142577
25	NC_011996	AGA	2	6	1280	1285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142577
26	NC_011996	AGA	2	6	1412	1417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142577
27	NC_011996	AG	3	6	1455	1460	50 %	0 %	50 %	0 %	222142577
28	NC_011996	AAG	2	6	1465	1470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142577
29	NC_011996	AGA	2	6	1474	1479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142577
30	NC_011996	AGT	2	6	1517	1522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142577
31	NC_011996	ATTT	2	8	1535	1542	25 %	75 %	0 %	0 %	222142577
32	NC_011996	TGA	2	6	1556	1561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142577
33	NC_011996	TAC	2	6	1600	1605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142577
34	NC_011996	GAA	2	6	1620	1625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142577
35	NC_011996	AAAG	2	8	1725	1732	75 %	0 %	25 %	0 %	222142577
36	NC_011996	AATA	2	8	1740	1747	75 %	25 %	0 %	0 %	222142577
37	NC_011996	AT	3	6	1778	1783	50 %	50 %	0 %	0 %	222142578
38	NC_011996	CAG	2	6	1810	1815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222142578
39	NC_011996	GAT	2	6	1827	1832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142578
40	NC_011996	TAT	2	6	1844	1849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142578
41	NC_011996	ATGG	2	8	1945	1952	25 %	25 %	50 %	0 %	222142578
42	NC_011996	ATG	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142578
43	NC_011996	ATT	2	6	1986	1991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142578
44	NC_011996	TTA	2	6	2021	2026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142578
45	NC_011996	AAG	2	6	2044	2049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142578
46	NC_011996	CTT	2	6	2071	2076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142578
47	NC_011996	ACA	2	6	2110	2115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142578
48	NC_011996	GTG	2	6	2168	2173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222142578
49	NC_011996	TTG	2	6	2207	2212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142578
50	NC_011996	AT	3	6	2277	2282	50 %	50 %	0 %	0 %	222142578
51	NC_011996	AAT	2	6	2284	2289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142578
52	NC_011996	GAA	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142578
53	NC_011996	TAAGT	2	10	2388	2397	40 %	40 %	20 %	0 %	222142578
54	NC_011996	GAAA	2	8	2404	2411	75 %	0 %	25 %	0 %	222142578
55	NC_011996	TGG	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222142578
56	NC_011996	GAA	2	6	2461	2466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142578
57	NC_011996	AATTTA	2	12	2480	2491	50 %	50 %	0 %	0 %	222142578
58	NC_011996	CTT	2	6	2541	2546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142578
59	NC_011996	TTCA	2	8	2554	2561	25 %	50 %	0 %	25 %	222142578
60	NC_011996	ATG	2	6	2617	2622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142578
61	NC_011996	AATT	2	8	2639	2646	50 %	50 %	0 %	0 %	222142578
62	NC_011996	AGC	2	6	2658	2663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222142578
63	NC_011996	ACA	2	6	2674	2679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142578
64	NC_011996	TA	3	6	2779	2784	50 %	50 %	0 %	0 %	222142578
65	NC_011996	CTA	2	6	2875	2880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142578
66	NC_011996	AGC	2	6	2931	2936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222142578
67	NC_011996	TGG	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222142578
68	NC_011996	AAT	2	6	3004	3009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142578
69	NC_011996	TGG	2	6	3060	3065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222142578
70	NC_011996	CAG	2	6	3071	3076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222142578
71	NC_011996	TCT	2	6	3115	3120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142578
72	NC_011996	TAA	2	6	3144	3149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142578
73	NC_011996	CAG	2	6	3194	3199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222142578
74	NC_011996	TAT	2	6	3216	3221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142578
75	NC_011996	TTA	2	6	3358	3363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142578
76	NC_011996	GAAA	2	8	3373	3380	75 %	0 %	25 %	0 %	222142578
77	NC_011996	GAT	2	6	3421	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142578
78	NC_011996	AGA	2	6	3531	3536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142578
79	NC_011996	CAG	2	6	3542	3547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222142578
80	NC_011996	AAT	2	6	3574	3579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142578
81	NC_011996	AGA	2	6	3588	3593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142578
82	NC_011996	CAG	2	6	3638	3643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222142578
83	NC_011996	TCTA	2	8	3669	3676	25 %	50 %	0 %	25 %	222142578
84	NC_011996	ATA	2	6	3680	3685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142578
85	NC_011996	AGA	2	6	3699	3704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142578
86	NC_011996	GTT	2	6	3723	3728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142578
87	NC_011996	GTG	2	6	3743	3748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222142578
88	NC_011996	GACA	2	8	3814	3821	50 %	0 %	25 %	25 %	222142578
89	NC_011996	CAA	2	6	3857	3862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142578
90	NC_011996	GA	3	6	3883	3888	50 %	0 %	50 %	0 %	222142578
91	NC_011996	AGA	2	6	3926	3931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142578
92	NC_011996	GACA	2	8	4039	4046	50 %	0 %	25 %	25 %	222142578
93	NC_011996	CAA	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142578
94	NC_011996	AGGC	2	8	4096	4103	25 %	0 %	50 %	25 %	222142578
95	NC_011996	GTA	2	6	4133	4138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142578
96	NC_011996	TGAGTA	2	12	4247	4258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142578
97	NC_011996	ACAA	2	8	4319	4326	75 %	0 %	0 %	25 %	222142578
98	NC_011996	GTCA	2	8	4342	4349	25 %	25 %	25 %	25 %	222142578
99	NC_011996	AAC	2	6	4373	4378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142578
100	NC_011996	CAG	2	6	4402	4407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222142578
101	NC_011996	TCT	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222142578
102	NC_011996	TTCG	2	8	4453	4460	0 %	50 %	25 %	25 %	222142578
103	NC_011996	GAA	2	6	4486	4491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142578
104	NC_011996	ATC	2	6	4515	4520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142578
105	NC_011996	CAA	2	6	4627	4632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142578
106	NC_011996	TTTA	2	8	4671	4678	25 %	75 %	0 %	0 %	222142578
107	NC_011996	AT	3	6	4709	4714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011996	ATT	2	6	4752	4757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011996	ATTA	2	8	4862	4869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011996	ATG	2	6	4877	4882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011996	ATT	2	6	4892	4897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011996	T	6	6	4943	4948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011996	AAC	2	6	4998	5003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011996	GAC	2	6	5009	5014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011996	AAT	2	6	5021	5026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011996	AAT	2	6	5033	5038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011996	CAA	2	6	5041	5046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011996	ATT	2	6	5049	5054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011996	CCT	2	6	5068	5073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_011996	T	7	7	5171	5177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011996	AAAT	2	8	5186	5193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011996	AGG	2	6	5194	5199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011996	AT	3	6	5260	5265	50 %	50 %	0 %	0 %	222142579
124	NC_011996	ATC	2	6	5268	5273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142579
125	NC_011996	AAC	2	6	5279	5284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222142579
126	NC_011996	ATT	2	6	5304	5309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142579
127	NC_011996	GTT	2	6	5316	5321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142579
128	NC_011996	TGG	2	6	5351	5356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222142579
129	NC_011996	TAT	2	6	5372	5377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142579
130	NC_011996	ATT	2	6	5382	5387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142579
131	NC_011996	GATTGC	2	12	5405	5416	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222142579
132	NC_011996	GGAT	2	8	5473	5480	25 %	25 %	50 %	0 %	222142579
133	NC_011996	AT	3	6	5513	5518	50 %	50 %	0 %	0 %	222142579
134	NC_011996	A	7	7	5561	5567	100 %	0 %	0 %	0 %	222142580
135	NC_011996	AG	3	6	5578	5583	50 %	0 %	50 %	0 %	222142580
136	NC_011996	GAAA	3	12	5592	5603	75 %	0 %	25 %	0 %	222142580
137	NC_011996	GATT	2	8	5618	5625	25 %	50 %	25 %	0 %	222142580
138	NC_011996	AT	3	6	5629	5634	50 %	50 %	0 %	0 %	222142580
139	NC_011996	AAG	2	6	5665	5670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142580
140	NC_011996	AGA	2	6	5684	5689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142580
141	NC_011996	AT	3	6	5706	5711	50 %	50 %	0 %	0 %	222142580
142	NC_011996	CAT	2	6	5779	5784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142580
143	NC_011996	AGA	2	6	5801	5806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142580
144	NC_011996	TCATT	2	10	5815	5824	20 %	60 %	0 %	20 %	222142580
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146	NC_011996	TGTC	2	8	6004	6011	0 %	50 %	25 %	25 %	222142580
147	NC_011996	CAGA	2	8	6026	6033	50 %	0 %	25 %	25 %	222142580
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151	NC_011996	A	7	7	6075	6081	100 %	0 %	0 %	0 %	222142580
152	NC_011996	AC	3	6	6112	6117	50 %	0 %	0 %	50 %	222142580
153	NC_011996	AT	4	8	6119	6126	50 %	50 %	0 %	0 %	222142580
154	NC_011996	TA	3	6	6151	6156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011996	TA	3	6	6170	6175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011996	A	6	6	6246	6251	100 %	0 %	0 %	0 %	222142581
157	NC_011996	TGA	2	6	6278	6283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142581
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159	NC_011996	G	6	6	6335	6340	0 %	0 %	100 %	0 %	222142581
160	NC_011996	A	6	6	6366	6371	100 %	0 %	0 %	0 %	222142581
161	NC_011996	AT	3	6	6399	6404	50 %	50 %	0 %	0 %	222142581
162	NC_011996	TCA	2	6	6463	6468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142581
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171	NC_011996	TCATT	2	10	7085	7094	20 %	60 %	0 %	20 %	222142581
172	NC_011996	G	6	6	7142	7147	0 %	0 %	100 %	0 %	222142581
173	NC_011996	GAT	2	6	7151	7156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142581
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180	NC_011996	AGA	2	6	7451	7456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142581
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202	NC_011996	TTA	3	9	8220	8228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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232	NC_011996	A	6	6	9409	9414	100 %	0 %	0 %	0 %	222142582
233	NC_011996	AATTAT	2	12	9448	9459	50 %	50 %	0 %	0 %	222142583
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238	NC_011996	A	7	7	9585	9591	100 %	0 %	0 %	0 %	222142583
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251	NC_011996	T	6	6	9994	9999	0 %	100 %	0 %	0 %	222142583
252	NC_011996	AT	3	6	10012	10017	50 %	50 %	0 %	0 %	222142583
253	NC_011996	A	8	8	10019	10026	100 %	0 %	0 %	0 %	222142583
254	NC_011996	AATG	2	8	10028	10035	50 %	25 %	25 %	0 %	222142583
255	NC_011996	A	6	6	10044	10049	100 %	0 %	0 %	0 %	222142583
256	NC_011996	TTAA	2	8	10095	10102	50 %	50 %	0 %	0 %	222142583
257	NC_011996	GA	3	6	10111	10116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
258	NC_011996	ATTT	2	8	10128	10135	25 %	75 %	0 %	0 %	222142584
259	NC_011996	AAAT	2	8	10141	10148	75 %	25 %	0 %	0 %	222142584
260	NC_011996	AGA	2	6	10240	10245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222142584
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263	NC_011996	ATA	2	6	10368	10373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222142584
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267	NC_011996	GTT	2	6	10493	10498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222142584
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269	NC_011996	ATC	2	6	10521	10526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222142584
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271	NC_011996	TTA	2	6	10560	10565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222142584
272	NC_011996	TGA	2	6	10630	10635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222142584
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